Заместитель заведующего

Центр коллективного пользования «NanoString» (ЦКП «NanoString») создан в 2021 году при финансовой поддержке Российской Федерации в лице Министерства науки и высшего образования Российской Федерации (соглашение от 29 сентября 2021 г. №075-15-2021-1073)

Основным направлением деятельности является обеспечение выполнения исследований на системе цифрового пространственного профилирования GMX-DSP-1Y для сотрудников СибГМУ и иных заинтересованных пользователей. 

Технология Nanostring является передовой технологией пространственной транскриптомики, которая позволяет напрямую измерить уровень транскриптомной активности генов и уровень трансляции соответствующих им белков, а также профилировать экспрессию микроРНК с последующей оценкой копийности генов.

Основные преимущества технологии:

  • Высокая мультиплексность
  • Минимальное количество образца - один срез для анализа РНК или белков
  • 4-ех цветная визуализация для определения морфологического контента
  • Возможен повторный анализ слайдов при работе с белками
  • Настраиваемая разрешающая способность – выбор участка интереса от 600 микрон до единичной клетки
  • Высокая пропускная способность – до 20 срезов в день
  • Количественный подсчет мишеней

Инфраструктура

  • Система пространственного профилирования GeoMx Digital Spatial Profiler (NanoString Technologies)
  • Система мультиплексного цифрового анализа нуклеиновых кислот nCounter SPRINT™ Profiler.