Кафедра медицинской и общей химии была организована в 1888 первой химической кафедрой университета и оставалась единственной до 1893 года. В 1893 году произошло разделение кафедры на две — кафедру общей и кафедру медицинской химии. В 1935 году из кафедры медицинской химии выделилась кафедра органической химии, а с 1953 года на ней стали преподавать и физико-коллоидную химию.
С 1888 по 1893 год первым заведующим кафедрой общей и медицинской химии был Станислав Иософатович Залесский. В 1881 году он окончил медицинский факультет Варшавского университета и получил степень лекаря с отличием. Станислав Залесский отклонил предложение остаться ассистентом в университете, так как решил посвятить свою деятельность химии.
Станислав Залесский вольнослушателем изучил полный курс химии в Дерптском университете и остался ассистентом при кафедре фармакологии и химии. В 1886 году защитил диссертацию «Исследования над печенью. Железо печени» на степень доктора медицины. С 1888 года Станислав Залесский — ординарный профессор по кафедре химии Томского университета, занимался изучением минеральных источников Сибири.
Преподавательский персонал кафедры состоял из одного профессора и одного лаборанта. Размещалась в то время кафедра в трех небольших комнатах на втором этаже главного здания университета, а студенческие лаборатории располагались в трех комнатах подвального помещения.