В настоящее время музей насчитывает более 2000 экспонатов по нормальной анатомии человека. Изящно выполненные, «ювелирной обработки» препараты нервной, опорно-двигательной, сердечно-сосудистой, лимфатической, дыхательной, пищеварительной и мочеполовой систем по-прежнему восхищают гостей музея.
В музее также находятся коллекции препаратов пре- и постнатального периодов развития человека и животных, а также препараты пороков развития.
Уникальна коллекция мумий, возраст которых исчисляется столетиями.
Особой гордостью музея является коллекция черепов, собранная прозектором Чугуновым С. М. в конце XIX века, которая до сих пор привлекает внимания антропологов.
Влажные препараты в растворе формалина, костные и костно-восковые препараты, коррозионные препараты и муляжи — далеко не полный перечень того, что есть в коллекции музея. Экспонаты наглядно демонстрируют практически все органы и системы человеческого организма и являются необходимым наглядным пособием для будущих врачей.