Каждый первокурсник-мужчина и девушка, имеющая среднее-медицинское образование, поступившие в СибГМУ, обязаны состоять на воинском учете в военном комиссариате по месту временного или постоянного проживания.
Поступление в СибГМУ дает возможность студенту, обучающемуся по очной форме обучения, реализовать свое право на получение отсрочки от призыва в ряды ВС РФ, в соответствии с Федеральным законом от 28 марта 1998 г. № 53-ФЗ «О воинской обязанности и военной службе» статья 24.