СибГМУ уделяет особое внимание сотрудничеству со стратегическими партнерами, выступает инициатором создания новых профессиональных объединений.
Привлекает новых партнеров для организации на их базе учебных практик для студентов и ординаторов. Разрабатывает совместные курсы повышения квалификации для специалистов, проводит научно-исследовательские и научно-образовательные проекты, получает поддержку в оснащении учебного процесса, повышает стипендиальный фонд для стимулирования наиболее успешных и активных студентов.
Партнеры педиатрического факультета:
- Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук;
- Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича;
- Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого;
- Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В. И. Кулакова;
- НИИ педиатрии и охраны здоровья детей;
- ФГБУН Институт органического синтеза им. И.Я. Постовского Уральского отделения РАН;
- Институт цитологии и генетики СО РАН;
- Национальный исследовательский Томский государственный университет;
- Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет).