СибГМУ уделяет особое внимание сотрудничеству со стратегическими партнерами, выступает инициатором создания новых профессиональных объединений. 

Привлекает новых партнеров для организации на их базе учебных практик для студентов и ординаторов. Разрабатывает совместные курсы повышения квалификации для специалистов, проводит научно-исследовательские и научно-образовательные проекты, получает поддержку в оснащении учебного процесса, повышает стипендиальный фонд для стимулирования наиболее успешных и активных студентов.

Партнеры педиатрического факультета:  

  • Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук;
  • Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича;
  • Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого;
  • Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В. И. Кулакова;
  • НИИ педиатрии и охраны здоровья детей;
  • ФГБУН Институт органического синтеза им. И.Я. Постовского Уральского отделения РАН;
  • Институт цитологии и генетики СО РАН;
  • Национальный исследовательский Томский государственный университет;
  • Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет).