Отдел отвечает за проведения независимых оценок качества образования университета, взаимодействие с уполномоченными федеральными органами исполнительной власти по вопросам лицензирования и государственной аккредитации.
Сотрудники отдела занимаются мониторингом и контролем выполнения нормативных, локальных актов СибГМУ в сфере образования.