Чтение курса нервных и душевных болезней в Императорском Томском университете началось с осеннего полугодия 1891-1892 учебного года. Первым профессором по кафедре нервных и душевных болезней был Яков Афанасьевич Анфимов. С 1 февраля 1895 года заведование кафедрой перешло к профессору Михаилу Николаевичу Попову, который увлекался физиотерапией и гипнотерапией. Психиатрию преподавали на 4 и 5 курсах. Тематика лекций ежегодно менялась в соответствии с требованиями развивающейся науки.
В 1928 году была создана кафедра психиатрии, назначен первый и единственный ординатор, затем ассистент, Яков Львович Виккер. Кафедре психиатрии было передано всё оборудование экспериментально-психологической лаборатории, часть имущества, учебных пособий, книг.
При профессоре Германе Гольдблате, который заведовал кафедрой с 1929 до 1934 годы, активно работала психофизиологическая лаборатория. В этой лаборатории проводили психотехническое исследование учащихся и рабочих, а также психофизиологии труда. Сотрудники кафедры консультировали сложные случаи в психолечебнице и тесно контактировали с нервно-психиатрическим диспансером, школой-санаторием для детей-эпилептиков. Сотрудники вели научную работу, опубликовали ряд статей и небольших монографий. С июля 1936 года заведующим был утверждён профессор Александр Августович Перельман.